Родилась в деревне Малые Россохины Медянского района Кировской области 22 ноября 1933 года в семье крестьянина. В 1947 году закончила 4 класса Чураковской начальной школы, затем до 1949 года училась в Медянской семилетней школе. Семья была плохо обеспечена материально, поэтому после окончания 6 классов Софье Филипповне пришлось поступить в школу ФЗУ при кожевенном комбинате им. Коминтерна. В 1950 году вступает в ряды ВЛКСМ.
После окончания школы ФЗУ работала на комбинате с 1951 по 1955 год в качестве строчильщицы заготовительного цеха. Одновременно занималась в вечерней школе № 10 г. Кирова. Получив среднее образование, Софья Филипповна поступила учиться в Омутнинское педагогическое училище (1955 – 1957 гг.) В 1957 году была направлена в качестве учителя начальных классов на работу в Мурыгинскую среднюю школу. С августа 1964 года – учитель начальных классов Мурыгинской восьмилетней школы.
Имея хорошую теоретическую подготовку, Софья Филипповна проявила себя как учитель творческий, неугомонный. Детям было интересно на уроках: нестандартные задания, интересные задачки учительница придумывала сама. Внеурочные мероприятия надолго запоминались всем: и детям, и родителям, и коллегам.
Софья Филипповна проводила открытые уроки, внеурочные воспитательные мероприятия для коллег на высочайшем уровне! Всегда щедро делилась своим опытом и знаниями. Она всегда занимала активную жизненную позицию. Была председателем профсоюзного комитета, нештатным корреспондентом районной газеты. Читала лекции для родителей.
За достигнутые успехи в деле обучения и воспитания детей награждена Койкова Софья Филипповна многочисленными грамотами и благодарностями. Ей присвоены звания «Старший учитель» и «Отличник народного просвещения» (1988 г.). За долголетний труд вручена медаль «Ветеран труда».
Любили и уважали Софью Филипповну в коллективе учителей. Всегда жизнерадостная, весёлая, умеющая шуткой разрядить обстановку, она сплачивала коллектив. Не один концерт не обходился без песен и частушек этого педагога. Каждому учителю начальных классов к каждому дню рождения она сочиняла замечательные душевные поздравления в стихах, которые были похожи на маленькие рассказы об имениннике. Мастерица на все руки, на новогодние представления и сказки своими руками шила костюмы для выступления.
Софья Филипповна создала прекрасную семью, воспитала двоих сыновей. Коллеги вспоминали: «Двери её дома всегда были открыты для друзей и родственников. Любая из коллег могла подойти к Софье Филипповне за педагогическим или жизненным советом. Этот человек всегда выслушает, посочувствует, тактично направит «на путь» и поможет, чем сможет».
Умерла 14.03.2018 года.